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ibidi血管生成實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)裝置優(yōu)化和數(shù)據(jù)分析操作
µ-Slide 血管生成載玻片
1.選擇正確實(shí)驗(yàn)方案
進(jìn)行血管形成分析的第一步是確定實(shí)驗(yàn)方案。需要考慮三個(gè)最重要的考慮因素,分別是:
· 細(xì)胞類型——內(nèi)皮細(xì)胞中生理性地觀察到管形成
· 凝膠基質(zhì)——它需要與細(xì)胞相容,并且必須為細(xì)胞附著提供結(jié)合基序
· 培養(yǎng)基成分(要求生長因子)
2.實(shí)驗(yàn)前工作
在開始篩選實(shí)驗(yàn)之前,務(wù)必要做優(yōu)化實(shí)驗(yàn)程序和設(shè)置。
2.1. 實(shí)驗(yàn)裝置的優(yōu)化
細(xì)胞接種密度、數(shù)據(jù)采集時(shí)間點(diǎn)和血清濃度對(duì)數(shù)據(jù)值有很大影響。因此,創(chuàng)建嚴(yán)格對(duì)于生成可重復(fù)的數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)集之間的可比性至關(guān)重要。
2.1.1. 測量時(shí)間間隔
首先,選擇細(xì)胞濃度和促進(jìn)血管形成的設(shè)置來記錄時(shí)間曲線。對(duì)于人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞 (HUVEC) 每孔約 10,000 個(gè)細(xì)胞,使用具有減少生長因子的基質(zhì)膠TM值和不含血清或生長因子的細(xì)胞培養(yǎng)基就足夠了。
接下來,按照應(yīng)用說明制備凝膠和細(xì)胞懸液,“ibidi µ-Slide 血管生成的形成分析"。在凝膠表面播種細(xì)胞后,立即將載玻片放入顯微鏡的培養(yǎng)室中,并開始延時(shí)記錄。每 10 分鐘記錄一張圖像,使用基于軟件的工具在每個(gè)時(shí)間點(diǎn)調(diào)整焦點(diǎn)。或者,如果您的顯微鏡上沒有孵化室,則每小時(shí)記錄一次圖像,至少在前 8 - 10 小時(shí)內(nèi)。記錄每個(gè)圖像后立即將樣品放入細(xì)胞培養(yǎng)箱中。在過夜培養(yǎng)后記錄最終圖像。
最后,分析圖像并使用合適的軟件可視化曲線。參數(shù)(例如,總管長)的時(shí)間曲線通常如下圖所示。曲線上升到最大值(約 5 小時(shí)),然后下降到平均期(約 7 小時(shí)開始),然后慢慢變平(> 20 小時(shí))。由于所有四個(gè)關(guān)鍵參數(shù)的特征看起來相似,只評(píng)估一個(gè)參數(shù)就足夠了。我們選擇管總長度作為參數(shù),因?yàn)樵紙D像提供了一個(gè)控制,可以輕松地與評(píng)估圖像進(jìn)行比較。
24小時(shí)內(nèi)管長的時(shí)間響應(yīng)
最佳結(jié)果出現(xiàn)在最大階段以及不會(huì)迅速下降的穩(wěn)定階段。在上例中,4 小時(shí)時(shí)間點(diǎn)和 10 小時(shí)時(shí)間點(diǎn)是很好的測量參考點(diǎn)。
2.1.2. 細(xì)胞接種密度
要確定最佳細(xì)胞接種密度,請記錄細(xì)胞系的特征。
首先,在 5-40 x 10 3cells/ml 范圍內(nèi)進(jìn)行一系列稀釋,然后將細(xì)胞接種到凝膠表面。按照第 4.1.1 節(jié)中的說明將樣品孵育確定的時(shí)間長度,并記錄相襯圖像。每個(gè)細(xì)胞濃度執(zhí)行五次重復(fù)。
評(píng)估圖像,分別在第 3 節(jié)和第 5 節(jié)中提到。將數(shù)據(jù)可視化為圖表,如下所示。數(shù)據(jù)將顯示具有最大值的特性曲線。該最大值是您的細(xì)胞類型的*佳接種密度。
HUVEC 和 EA.hy926接種4小時(shí)后的密度響應(yīng)
2.1.3. 血清濃度
向培養(yǎng)基中添加血清可能會(huì)影響試管形成行為。在大多數(shù)情況下,血清抑制管形成。為避免此問題,請使用您在第 4.1.1 節(jié)和第 4.1.2 節(jié)中確定的條件測試不同的血清濃度,范圍為 0 - 20%。這將確定哪種血清濃度適合于血管生成和細(xì)胞存活。
2.1.4. 放大倍數(shù)
放大倍數(shù)決定了能夠被相機(jī)成像的孔區(qū)域。由于管的形成發(fā)生在孔的整個(gè)表面區(qū)域,重要的是盡可能地對(duì)最寬的部分進(jìn)行成像。如果不需要檢測細(xì)胞內(nèi)細(xì)節(jié),請使用低倍率(4 倍或 5 倍)。如果需要檢測細(xì)胞內(nèi)細(xì)節(jié),建議對(duì)每個(gè)孔拍攝幾張放大倍數(shù)更高的圖像并將它們拼接在一起
2.2. 建立陽性和陰性對(duì)照
要?jiǎng)?chuàng)建陽性對(duì)照,請選擇確保血管形成的實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)(例如,具有減少生長因子的基質(zhì)膠TM值和用于 HUVEC 的無血清培養(yǎng)基)。陽性對(duì)照確保細(xì)胞是健康的,并且觀察到的任何抗血管生成作用都是由所研究的物質(zhì)引起的。
要?jiǎng)?chuàng)建陰性對(duì)照,請選擇一種經(jīng)證實(shí)對(duì)血管形成發(fā)展具有抑制作用的物質(zhì)(例如,用于 HUVEC 的蘇拉胺)。陰性對(duì)照確保可以抑制細(xì)胞中的管形成,并為您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果提供一個(gè)比較點(diǎn)。
2.3. 實(shí)驗(yàn)計(jì)劃和重復(fù)次數(shù)
在進(jìn)行實(shí)驗(yàn)之前,計(jì)算所需材料的數(shù)量,例如細(xì)胞、培養(yǎng)基、凝膠基質(zhì)和物質(zhì)。還要計(jì)算實(shí)驗(yàn)室設(shè)備和空間要求以及時(shí)間表。
為了正確地進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,建議至少進(jìn)行四次獨(dú)立實(shí)驗(yàn),每個(gè)實(shí)驗(yàn)至少有 8 個(gè)單孔。所需的實(shí)驗(yàn)次數(shù)取決于數(shù)據(jù)的均勻性。遵循嚴(yán)格的協(xié)議對(duì)于數(shù)據(jù)采集至關(guān)重要。
對(duì)數(shù)據(jù)集執(zhí)行學(xué)生 T 檢驗(yàn)。p 值 ≤ 0.05* (≤ 0.01**) 表示該模型有足夠的功效,無需額外實(shí)驗(yàn)即可繼續(xù)。
2.4. 文檔
合理的文檔包括本節(jié)中確定的所有參數(shù)。生成一個(gè)表格圖表,其中每個(gè)實(shí)驗(yàn)都記錄在一列中。附錄中給出了一個(gè)例子。
3.數(shù)據(jù)分析
每個(gè)分析孔生成一個(gè)管長度值。然后將一個(gè)實(shí)驗(yàn)(每個(gè)條件至少 8 個(gè)孔)的值相加并計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)偏差。標(biāo)準(zhǔn)偏差應(yīng)小于 10%。這只是一個(gè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)點(diǎn)。
左圖顯示了在四個(gè)不同時(shí)間點(diǎn),一種實(shí)驗(yàn)條件下單孔結(jié)果的分布。右圖顯示了一種實(shí)驗(yàn)條件在四個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)的平均結(jié)果。
為了正確穩(wěn)定的統(tǒng)計(jì)分析,每個(gè)條件至少需要四個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)。請記住,每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)由 8 個(gè)單獨(dú)的孔組成。
單個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)合并為一個(gè)平均值,并可以顯示在條形圖中。統(tǒng)計(jì)分析是通過學(xué)生 T 檢驗(yàn)完成的,其中對(duì)不同的數(shù)據(jù)點(diǎn)群體進(jìn)行相互檢驗(yàn)。